在臨床實際的應用，許多案例常需要借重不同的儀器設備進行拍攝，以取得最佳的訊息；或是在不同時間拍攝，來了解相關病徵的進展，這些情況下，都會同時有多組影像資料需要進行比對。
在Amira/Avizo中，我們提供完整的影像校準對位，包含標記點對位校準、曲面網格
對位 點校準、影像共同資訊校準對位，無論任何一種資料數據，只要能匯入，都能找到最佳的功能模組，將兩組不同座標影像運算至相同座標位置以便比對。
左圖：影像校準對位前；右圖：影像已完成對位校準。
影像可直接使用NMI的方式進行對位，使用者無法標記任何座標點，Amira/Avizo即可正確找到最佳位置。
對位校準後的影像，透過重新切面運算產生相同尺寸影像後，在影像圈選工作室(Image Segmentation)即可自由切換，例如腫瘤在MRI中較容易辨識，我們就可以在MRI影像中圈選腫瘤；骨骼在CT中較容易辨識，我們就可以在CT影像中圈選骨頭，如此就能快速精確完成整個案例模型的製作與評估。