Amira生物醫學三維影像分析暨三維打印平台

Amira®為一功能全面的三維影像資料處理平台,用於分析來自電腦斷層掃描、顯微鏡、磁振造影和各式設備擷取的影像資料。憑藉令人難以置信的效率和靈活性,Amira提供給臨床醫療人員或生技產業研發者,縝密的分析數據和高解析的立體成像,無論是在影像科、牙科、內科、外科、神經科、分子細胞生物學以及生物醫學工程……等,均有品質卓越的展現與應用。

主要功能

檔案讀取與輸出

  • 點陣圖檔格式:TIFF、BMP、JPEG、PNG、SGI
  • 顯微鏡特有圖檔格式:FEI、Leica、Zeiss、Bio-Rad、Olympus、MRC
  • 醫學影像圖檔格式:DICOM、Analyze
  • 神經科學檔案格式:Nifti、Hoc、SWC
  • 分子模擬格式:(須加購XMolecular模組) PDB 、AMF、GROMACS、MDL、ZIB Molecular File Format
  • 有限元素模型檔案:(須加購XMesh模組) FIDAP*、I-DEAS、Fluent、Abaqus+
  • 幾何模型檔案及電腦輔助設計檔案:DXF、STL、VRML、Open Inventor
  • 多選項原始資料數據檔案讀取
  • 支援超大資料檔案

資料處理

  • 二維和三維影像檔案濾波
  • 去卷積運算及Z軸灰階調校
  • 互動式/全自動切片對齊排正
  • 影像校準對位及變形
  • 互動式/自動影像圈選分割
  • 微管結構、血管或神經網絡之骨架擷取與追蹤
  • 提供專用影像圈選分割、細絲編修與三維影像校準融合編輯器
  • 曲面網格重建
  • 有限元素實體網格生成 (須加購XMesh模組)
  • 張量計算(須加購XMesh模組或XNeuro模組)
  • 擴散張量影像之纖維追蹤 (須加購XNeuro模組)
  • 功能強大的TCLPython直述指令控制介面
  • 可支援多核心平行運算

可視化與探索

  • 互動式高品質影像視覺化展示
  • 正交和斜切片
  • 體積影像和曲面網格渲染
  • 等值曲線和等值曲面
  • 多頻道影像成像
  • 影像融合
  • 向量和張量可視化(須加購XMesh模組)
  • 支持結構化和非結構化網格(須加購XMesh模組)
  • 分子可視化(須加購XMolecular模組)

分析與測量

  • 體積、面積和距離測量
  • 密度測定、灰階值統計
  • 細絲網絡統計分析
  • 共同定位分析
  • 成分分離、計數和形狀分析(須加購XImagePAQ模組)
  • 對影像、向量場和非結構化網格的數值計算(須加購XMesh模組)
  • Matlab®連結使用(須先安裝Matlab®)

成果展示

  • 影片錄製與輸出
  • 進階時序編製與物件動畫製作
  • 主動和被動3D立體視覺
  • 支援虛擬導覽工具(須加購XScreen模組)
  • 單個或多個螢幕拼接顯示(須加購XScreen模組)
  • 浸入式虛擬實境檢視(須加購XScreen模組)
  • 配合相容之3D列印設備做實體輸出

Amira 基本版已提供功能完整齊全的工具模組,不過為滿足不同應用領域的特殊需求,可透過加購擴充模組來延伸Amira可應用領域。

XImagePAQ 包含功能強大的影像強化演算,能簡化或自動化影像圈選分割,並提供標靶物件、細胞與組織特徵定量與測量功能。

XNeuro 提供擴散張量影像研究需要的所有工具,包括張量可視化、定向編碼彩色影像(DEC))和纖維追蹤。此外,此擴充模組還支援時變磁振造影與電腦斷層灌注加權影像數據分析。

XTracing 可在高雜訊影像中檢測和追蹤細絲或管狀結構,例如分析低溫電子顯微鏡斷層影像中肌動蛋白纖維或微管細絲的結構。

XMolecular 使Amira成為一款全功能分子可視化工具。與其他分子影像軟體相比,XMolecular讓您無縫結合Amira基本產品中的三維影像可視化與處理功能及最先進的分子可視化和編輯功能。

XMesh 可將三維影像轉換為三維四面體網格,以便輸出有限元素分析時所需之數位模型,並支援高品質的純量、向量和張量場所需的顯示模組。

XWind 可在生物力學等應用中,分析、可視化和呈現有限元素分析(FEA)和計算流體力學(CFD)模擬之數據。XWind支援更廣泛的第三方求解器之模型讀取與模擬成果讀入之功
能,進一步延伸XMesh不足之處。XWind還增加了對這些模組結果進行資料後處理之進階功能。

XLVolume 使用高效的核心外數據(out-of-core)管理演算,當電腦中可用記憶體無法容納欲展示的巨大資料時,透過XLVolume一樣能執行正交切面、斜切面、體積渲染和等值曲面等可視化展示功能。

XPand 可以讓您使用C++客制化開發全新之可視化和資料處理模組或提供檔案之讀取與輸出。XPand中還提供開發精靈,讓您快速設定開發所需之參數。

Amira Cell Biology專為4D+影像的研究人員提供完整的資料處理、三維動態追蹤及數據量化分析功能與模組,可快速準確得到相關研究所需數據。