圖譜自動分割

在生命科學影像分析領域,精確與效率至關重要。Reactiv’IPCERMEP 攜手合作,基於強大的 IPSDK Explorer 平台,開發了一款專為放射自顯影 (Autoradiography) 需求量身打造的處理軟體。這款工具不僅能滿足複雜的分析需求,更能將切片與現有的圖譜 (Atlas) 進行精準匹配。

Reactiv'IP 放射自顯影切片序列定義介面
圖一:定義切片序列並配對相應部分(Total 與 Specific fixation)

主要功能流程

  • 1
    切片序列定義 (Slice Series Definition):
    軟體首先定義一系列切片,並將對應的切片部分(如總結合與特異性結合)進行配對。
  • 2
    感興趣區域選擇 (ROI Selection):
    針對每個序列進行精確的 ROI 圈選。
  • 3
    自動輪廓偵測與修正 (Contour Determination):
    系統會自動計算並判定切片輪廓。使用者保留完全的控制權,可在必要時手動微調自動生成的輪廓。
圖二:輪廓驗證後,利用微調參數(旋轉、縮放、平移)將切片與圖譜連結

圖譜連結與自動報告

當輪廓確認無誤後,軟體將利用微調參數(旋轉、縮放、平移)將每個切片與標準圖譜進行連結。完成所有步驟並驗證後,系統將自動生成結果表單,其中包含該序列所有的測量數據,大幅節省人工統計的時間。

為什麼選擇這套解決方案?

⚡ 高度自動化

從輪廓識別到報告生成,自動化流程顯著提升實驗效率。

🎯 精確靈活

結合自動偵測與手動微調功能,確保每個樣本的分析準確無誤。

🔬 專業整合

專為放射自顯影與圖譜匹配設計,解決通用軟體難以處理的特定需求。

自動氣管、肺臟及胸腔骨骼提取

透過Amira的清單工作室,用戶可以自訂需要的分析流程,結合這些流程定義出針對特定影像的分析模組。

我們針對胸腔電腦斷層影像提供一系列的分析模組,用戶只需要簡單的從清單中選取功能,即可完成氣管提取、肺臟提取及骨骼提取,完成後即可輸出成三維列印的STL檔案,或錄製所需的動劃影片。

您可以參考以下視頻操作。